一.進樣后不出色譜峰
故障表現：氣相色譜儀在進樣后檢測信號沒有變化，儀器不出峰，輸出仍為直線。
解決方法：遇到這種情況時，應按從樣品進樣針、進樣口到檢測器的順序逐一檢查。
1、首先檢查注射器是否堵塞，
2、再檢查進樣口和檢測器的石墨墊圈是否緊固、漏氣，
3、然后檢查色譜柱是否有斷裂漏氣情況，
4、最后觀察檢測器出口是否暢通。
5、進樣口、注射器、墊圈和色譜柱都正常，但是進樣口柱頭壓達不到設定值，總是偏高，這時可能是ECD檢驗器出口不暢通。由于ECD的排放物有一定的放射性，所以ECD出口是引到室外的，可能會因天氣原因造成儀器ECD的出口堵塞，柱頭壓居高不下，氣體在氣路中無法流動，也就無法載樣品到檢測器，所以不出峰。
二．基線問題
故障表現：氣相色譜基線波動、飄移都是基線問題。基線問題可使測量誤差增大，有時甚至會導致儀器無法正常使用。
解決方法：
1、遇到基線問題時應先檢查儀器條件是否有改變，近期是否新換氣瓶及設備配件。
如果有更換或條件有改變，則要先檢查基線問題是不是由這些改變造成的。一般來說，這種變化往往是產生基線問題的原因。
2、當排除了以上可能造成基線問題的原因后，則應當檢查進樣墊是否老化（應養成定期更換進樣墊的好習慣）。
3、檢查石英棉是否該更換。
4、檢查襯管是否清潔。
5、此外檢測器污染也可能造成基線問題，其可以通過清洗或熱清洗的方法來解決。
三．峰丟失
造成峰丟失的原因有兩種：一是氣路中有污染，二是峰沒有分開。
（一）第一種情況可通過多次空運行和清洗氣路（進樣口、檢測器等）來解決。
1、為了減少對氣路的污染，可采用以下的措施：程序升溫的最后階段應有一個高溫清洗過程；
2、注入進樣口的樣品應當清潔；
3、減少高沸點的油類物質的使用；
4、使用盡量高的進樣口溫度、柱溫和檢測器溫度。
（二）峰沒有分開除了以上原因外，也有可能是系統污染造成的柱效下降造成，或是由于柱子老化導致的，但柱子老化所造成的峰丟失是漸進的、緩慢的。其解決方法是通過檢查漏氣和去除污染來解決。在平時的工作中應當記錄正常時基線的情況，以便在維護時作參考。
