一、氣相色譜儀氣路部分不正常
是指氣路系統出現堵塞、泄漏、無壓力指示、無氣體輸出等故障。
A.檢查氣源部分（氣瓶、氣體發生器等）是否正常。
B.利用輸入氣體壓力表檢查氣體輸入是否正常，否則檢查凈化器等外部氣路及穩壓閥等是否正常。
C.如果是載氣流路，則可在色譜柱前后檢查進樣器的氣體輸出是否正常，否則檢查穩壓閥至色譜柱這一段。
D.如果是氫氣或空氣流路，則可利用儀器頂部的氣路轉接架檢查氣體輸出是否正常，否則檢查穩壓閥至氣路轉接架這一段。
E.檢查檢測器的氣體輸入、輸出是否正常。
F.在氣路系統的適當地方進行封堵，并觀察相應壓力表的指示變化，是檢查漏氣的常用方法。
G.安全起見，可以利用氮氣對氫氣流路進行檢查。
二、氣相色譜儀儀器啟動不正常
是指接通電源后，儀器無反應或初始化不正常。
A.關機并拔下電源插頭，檢查電網電壓以及接地線是否正常。
B.利用萬用表檢查主機保險絲、變壓器及其連接件、電源開關及其連接件、以及其他連接線是否正常。
C.插上電源插頭并重新開機，觀察儀器是否已經正常。
D.如果啟動正常，而初始化不正常，則根據提示進行相應的檢查。
E.如果馬達運轉正常，而顯示不正常，則檢查鍵盤/顯示部分是否正常。
F.如果顯示正常，而馬達運轉不正常，則檢查馬達及其變壓器、保險絲等是否正常。
G.必要時可拔去一些與初始化無關的部件插頭，并進行觀察。
H.如果初始化仍不正常，則基本上可確定是微機板故障。
三、氣相色譜儀溫度控制不正常
是指不升溫或溫度不穩定。
A.所有溫度均不正常時，先檢查電網電壓及接地線是否正常。
B.所有溫度均不穩定時，可降低柱箱溫度，觀察進樣器和檢測器的溫度，如果正常，則是電網電壓或接地線引起的故障。
C.如果電網電壓和接地線正常，則通常是微機板故障，一般來說各路溫控的鉑電阻或加熱絲同時損壞的可能性極下。
D.如果是某一路溫控不正常，則檢查該路溫控的鉑電阻、加熱絲是否正常。
E.如果是柱箱溫控不正常，還要檢查相應的繼電器、可控硅是否正常。
F.如果鉑電阻、加熱絲等均正常，則是微機板故障。
G.在上述檢查過程中，要注意各零部件的接插件、連接線是否存在斷路、短路、以及接觸不良的現象。
四、氣相色譜儀點火不正常
是指指FID、NPD、FPD檢測器不能點火或點火困難。
A.檢查載氣、氫氣、空氣是否進入檢測器，否則檢查氣路部分。
B.檢查各種氣體的流量設置是否正確，否則重新設置。
C.觀察點火絲是否發紅，否則檢查點火絲是否斷路或短路、接觸不良，以及檢查點火絲形狀是否正常。
D.點火絲正常的情況下，FID、FPD檢測器觀察點火繼電器吸合是否正常，點火電流是否加到點火絲上，否則檢查相應的電路部分。
E.NPD檢測器在確認銣珠正常的前提下，觀察電流調節是否正常，否則檢查相應的電路部分。
F.檢查檢測器是否存在污染、堵塞現象。
H.檢查檢測器內部是否存在漏氣現象。
五、氣相色譜儀出部分反峰
是指大部分峰為正向出峰，但一部分峰為反向出峰，或基線往負方向偏移。
A.使用空氣壓縮機時，檢查確認反向出峰或基線往負方向偏移是否與空氣壓縮機的動作（空氣壓力不足時空氣壓縮機自動動作）在時間上是否同步。
B.較多水份進入離子化檢測器時，火焰的燃燒狀態短時間會起變化，伴隨出現反峰（這不是異常）。
C.檢查各種氣體的流量設置是否正常，以及是否存在漏氣現象。
D.檢查載氣的純度，如果載氣里面有微量不純物，而樣品的純度如果比載氣的純度高，就會出反峰。
E.氣路切換時有壓力沖擊，也會出現反峰，此時氣路中應加接穩壓裝置。
F.使用TCD時，如果載氣和樣品的熱導系數過于接近，也會出現一部分或全部的反峰。
六、氣相色譜儀出峰后零點偏移
是指樣品出完溶劑峰等平頂峰后基線不能回到原來的零點。
A.各氣體流量是否正常（數值、穩定）。
B.柱箱、檢測器的溫度是否正常（數值、穩定）。
C.檢測器是否被污染，如果污染進行清洗或更換零件
D.必要時在通入載氣的情況下，將檢測器的溫度設置在200℃以上進行數小時的老化。
D.色譜柱是否老化不足，必要時在載氣進入色譜柱的情況下，將色譜柱箱的溫度設置在色譜柱的最高使用溫度下30度左右進行10小時以上的老化，或用程序升溫方式進行老化。
E.減少進樣量。
F.使用TCD時，如果大量的氧成分注入TCD，會引起TCD鎢絲的阻值發生變化，使得基線無法回零，鎢絲的壽命也會減短。
七、氣相色譜儀基流過大、無法調零
是指對基線進行調零時，發現基流增大，零點與平時相比有偏離或無法調零。
A.將火焰熄滅或關閉電流之后基線還是無法回零時，要考慮是否電路系統的故障或接觸不良、絕緣退化等因素：
1.檢查檢測器和離子信號線是否有接觸不良、絕緣退化等現象。
2.檢查檢測器是否被污染，如果污染請進行清洗。
3.檢查檢測器溫度是否正常，必要時對檢測器進行老化。
4.檢查是否離子信號線故障、放大器電路板故障、輸出信號線故障、積分儀/工作站故障。
5.使用TCD時，檢查TCD鎢絲電流的設定是否太大。
B.色譜柱箱溫度冷卻到室溫，調零還是不正常時，要考慮檢測器自身的原因：
1.檢查各種氣體是否污染或流量不正常、漏氣。
2.檢查檢測器是否被污染，如果污染請進行清洗。
C.降低進樣口溫度后基始電流也不減少時：
1.檢查載氣是否污染或流量不正常。
2.檢查色譜柱安裝連接部分或進樣墊部分是否有漏氣現象。
3.檢討是否色譜柱老化不足，比要時在載氣進入色譜柱的情況下對色譜柱進行老化。
D.降低進樣器溫度后基始電流有縮減少時，可以判定是進樣口、進樣墊或進樣襯管等有污染現象，應對進樣器部分進行清洗。
八、氣相色譜儀全部出反峰
是指所有樣品均反向出峰。
A.檢查氣相色譜儀相應檢測器的信號輸出線與積分儀或記錄儀、色譜工作站的信號輸入端的連接是否正確，將信號輸出線的正負兩端對換即可。
B.對于具有極性切換功能的檢測器，檢查其輸出信號的正負極性設置是否正確，必要時更改正負極性的設置即可。
