概述
環境監測中的生物監測主要分成兩大類。一類是對生態系統中的現存的各類生物進行鑒定分析，以了解水體的污染情況（如水中細菌、藻類監測等），即生物生態監測；另一類是以某些特定培養的生物為受試生物，去檢測水體中對生物有害的毒物含量，即生物毒性檢測。
本文主要介紹環境監測生物生態實驗室的監測項目和儀器配置。
一、生物生態監測
1、水體細菌學測定
主要是細菌總數、糞大腸菌群，是環境監測的常規項目，當然有些時候還會要求做一些病原微生物的鑒定（主要包括是細菌培養、生化試驗、血清學試驗等）。
需要的儀器設備也比較簡單，主要是生化培養箱、超凈工作臺、高壓滅菌鍋。當然有條件最好有正規的無菌室，可以添置大腸菌群快速測定儀。
2、水生生物群落監測
2.1 藻類監測
藻類監測在太湖藍藻發生后越來越受到重視，在整個生物監測實驗室中屬于重點分析、研究項目。藻類監測的目的主要有2個，一是通過對水體中藻類群落進行分析，通過特定藻種對污染物的指示作用，反應水體污染情況；二是水華監測、預警與控制。目前環境部門的監測主要還是集中于水華監測、預警與控制上。
水華的監測的重點和難點就是藻類的鑒定和計數。目前主要由兩大類方法：傳統的形態學鑒定和分子生物學鑒定。形態學鑒定中使用的儀器主要是顯微鏡、流式細胞儀，而分子生物學鑒定中主要用PCR。此外還會用到葉綠素測定儀、光照度計、水質多參數儀等一些輔助參數儀器。
水華的相關研究，比如水華如何預測、如何控制等，主要用到細胞破碎儀、振蕩器、離心機、光照培養箱、低溫冰箱、接種及暫時培養中的藻類工作臺—超凈臺等輔助設備。
2.2 其他水生生物監測
其他水生生物監測一般從就是生物群落分析中獲取環境對生物群落影響的信息。如浮游動物、著生動物、底棲生物、潮間帶生物等。這類生物鑒定一般都是用形態學分析。主要儀器配置是解剖鏡，淡水浮游動物中的輪蟲和原生動物還需要用顯微鏡。
二、生物毒性監測
生物毒性監測是利用特定生物對不同濃度不同毒性的環境毒物的不同反應強度來評價環境毒物對生物的毒性作用。
生物毒性監測在水體毒性測試中用的比較多的是急性毒性測試，按照其受試生物的不同又可分成發光菌急性毒性測試、藻類急性毒性測試、蚤類急性毒性測試、魚類急性毒性測試（斑馬魚、青鳉魚等）、小鼠急性毒性測試等。
儀器配備：
a. 發光菌急性毒性測試：發光菌急性毒性測試系統，也可以買個便攜式熒光光度計做。
b. 藻類急性毒性測試：光照培養箱是必備的，計數可以用顯微鏡，還能葉綠素分析儀，有時還能用光度計。
c. 蚤類急性毒性測試&魚類急性毒性測試：如果只是測測半致死劑量，數個數就行，不用儀器，如果要提高精度，可以使用水質生物安全預警系統。
d. 小鼠急性毒性測試：嚴格按照標準建造的無菌室，需要有合理的布局和氣流組織。
三、其他
除了上述兩類外，其實還有生物危害性監測（姐妹染色單體交換（SCE）試驗、蠶豆根尖微核試驗）、二噁英檢測（利用離體大白鼠肝癌細胞的EROD誘導指示二惡英的復合毒性效應的方法）
（內容參考儀器信息網）
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