色譜柱是裝填有固定相用以分離混合組分的柱管。多為金屬或玻璃制作。有直管形、盤管形、U形管等形狀。可分為填充柱和開管柱兩大類。液相色譜通常均采用填充柱。由柱管、壓帽、卡套（密封環）、篩板（濾片）、接頭、螺絲等組成。
單抗類蛋白藥是非均一性的結構復雜的大分子，與傳統小分子藥不同，因此使這類原研藥或仿制藥的研發與質控工作難度增大。通過液相色譜-質譜聯用技術（LC/MS），結合蛋白分子量的測定、異構體、氨基酸修飾、糖基化修飾以及聚集情況分析等多種檢測手段，可對單抗類藥物進行全面的結構表征。
首先要對針對單抗藥物的各項物化性質和功能性指標進行對比分析試驗。利用尺寸排阻色譜法（SEC）的分子空間結構不同的原理可對抗體的多聚體、抗體片段以及PEG蛋白等進行有效分析。其中，對原研和仿制藥樣品的非均一性分析（抗體聚集情況分析）時使用了色譜柱。
硼酸鹽親和色譜法多用于對糖或糖蛋白等生物分子進行分離。可以使用親和色譜柱對樣品中糖基化和未糖基化的抗體異構體進行分離。
在通過N-糖苷酶F來釋放單克隆抗體Fc部分上的糖鏈，并對游離的N-末端糖鏈進行2-AB熒光標記后進行糖基化分析的過程中使用到了色譜柱用來分離2-AB標記的糖鏈。親水相互作用（HILIC）色譜柱適用于親水性低分子、核酸以及糖類等化合物的分離分析。在單抗藥物分析應用上，常用來分析結合在抗體上的糖鏈的結構差異性。
